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怎么确认丙肝病毒的基因分型

时间:2020-12-08 15:56 来源:康安途 作者:康安途海外就医

  应在开始适当治疗之前确定丙型肝炎病毒的基因型。对慢性丙型肝炎病毒的治疗类型取决于病毒的基因型。与其他基因型相比,基因1型丙肝导致更严重的肝损害,更快发展为肝硬化和肝癌。此外,与基因2型和3.13型相比,基因1型和基因4型感染丙肝的15例患者需要48周的治疗,基因2型和基因3型患者需要24周的治疗。  

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  在土耳其,最常见的基因型是基因型1b,其次是基因型1a。Genoypes2a,3a,4,4c的发生率较低。然而,在土耳其安纳托利亚中部的Kayseri市,第二大常见的基因型为4.1系统发育分析显示,该地区丙肝基因型4d样本与不同地理区域的基因型4d株系相似度为82-95%。根据分子钟分析,4d基因型菌株被认为是30-75年前来到这个地区的。 

  直接序列分析是一种广泛应用的基因分型方法。然而,序列分析有许多缺点。例如,它是昂贵的,耗时的,并且需要有经验的员工。因此,半自动系统被广泛使用。基于基因型特异性实时PCR的雅培实时丙肝基因型分析已广泛应用于丙肝基因型分析  

  早期研究报道1b亚型患者预后较1a亚型患者差。由于1型基因是土耳其以及其他许多国家最常见的基因型,所以分型很重要。Ciottietal.12评估了Abbott实时丙肝基因型II试验和Versant丙肝基因型2.0试验的性能,并报道了两种试验之间的良好一致性。型一致性为95.9%,基因1型亚型水平一致性为95.6%。  

  然而,2009年进行的一项研究表明,雅培实时丙型肝炎病毒基因型试验未能正确识别约10%的样本中的丙型肝炎病毒基因型1亚型。只有基因型1亚型可以通过雅培实时检测丙肝基因型II。在我们的研究中,通过Abbott实时丙肝基因型II测定和序列分析,100例患者中有70例发现基因1型。两种系统测定丙肝基因1型的一致性为100%。然而,在确定亚型时,五个样本的亚型被Abbott实时丙肝II基因型试验误归为1b基因型。通过序列分析,这5个样本被划分为1a基因型。这种差异在统计学上不显著。  

  Sohnetal.6在66例丙肝阳性样本中评估了限制性片段质量多态性(RFMP)和Abbott实时丙肝II基因型检测的性能。采用RFMP法鉴定1型39例,2型22例,3型5例。除三个样本外,这些结果通常与Abbott实时丙肝基因型II试验相一致。2例样品经Abbott实时丙肝基因型II鉴定为混合基因型(1b+3),RFMP鉴定为混合基因型1。  

  其中1例采用雅培实时丙肝基因型检测为混合基因型,RFMP检测为2型。此外,他们的研究报告了15份丙肝基因1型样本的亚型结果在两种方法之间不兼容。在我们的研究中,我们没有发现任何混合基因型的雅培实时丙型肝炎病毒基因型II。基因型2、基因型3、基因型4两种方法结果一致。  

  Yangetal.21表明,Abbott实时丙肝基因型II试验和Versant丙肝基因型2.0试验在识别丙肝基因型6方面存在局限性。然而,在我们的研究中,我们没有发现任何基因型6雅培实时丙肝病毒基因型II试验或序列分析。详情请扫码咨询:

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(责任编辑:康安途海外就医)

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