丙肝基因分型对于选择合适的丙肝病毒治疗方案至关重要

　　背景：　　

　　丙肝病毒感染的治疗取决于基因型和亚基因型。因此，正确的丙肝基因分型对于选择合适的治疗方案至关重要。　　

　　方法：　　

　　本研究纳入280例血浆样本，评估丙肝基因分型9G试验的效果。6型丙肝9G检测准确检测丙肝1a、1b、2、3、4、6个基因型，并与LiPA2.0检测和测序进行比较，评价其性能。

　　结果：　　

　　丙肝基因分型9G试验和LiPA2.0试验结果一致83.9%(n=235)。对两种检测结果不一致的39/45个样本进行测序分析。测序结果显示39个差异样本为0(丙肝1a)、24(丙肝1b)、1(丙肝6f)、12(丙肝6i)和2(丙肝阴性)。6个丙肝基因分型9G检测结果与测序结果非常相似，样本分别检测到丙肝1a、1b、3、6a、6f、6i、6n，阴性。　　

　　然而，LiPA2.0检测结果与测序结果完全不一致，因为它没有正确地检测到这39个样本中的任何一个。这些结果表明LiPA2.0检测方法在鉴定丙肝基因型1b时存在局限性。丙肝基因型9G检测的敏感性、特异性、PPV、NPV分别为99.5、98.8、99.5、98.8%。值得注意的是，丙肝基因分型9G测试显示，对丙肝1b和6基因分型分别有98.3和100%的敏感性。然而，LiPA2.0试验显示对这些基因型有57.9和71.7%的敏感性。　　

　　结论：　　

　　丙肝基因分型9G检测与测序结果一致，确定了丙肝1a,1b,2,3和6。因此，丙肝基因分型9G检测可以为医生提供重要信息，帮助他们正确使用药物，有效治疗丙型肝炎，具有很高的临床价值。　　

　　丙肝病毒(丙肝)感染会导致丙肝，一种肝脏疾病。在全球范围内，每年1.5亿慢性丙型肝炎感染者中约有70万人死于与丙型肝炎相关的肝病，如肝硬化、肝细胞癌和肝衰竭。丙肝病毒基因型和亚型的多样性使丙肝病毒感染的治疗复杂化。因此，丙肝感染导致的死亡率继续增加。丙肝有7个基因型和90多个亚型，具有不同的地理分布模式。从全球来看，丙肝基因型G1、G3、G2、G4、G6和G5的比例分别为46.2、30.1、9.1、8.3、5.4和0.8%。鉴定丙肝基因型和亚基因型对于正确的抗病毒治疗和治愈丙肝感染者至关重要。　　

　　2016年《世界卫生组织慢性丙型肝炎病毒感染筛查、护理和治疗指南》建议通过鉴定丙型肝炎病毒基因型来选择精确的治疗方案。这些指南还建议对丙肝RNA进行核酸检测，以决定是否开始对丙型肝炎进行治疗。欧洲肝脏研究协会(EASL)认为，对丙肝感染的治疗在很大程度上取决于的基因型和亚基因型。　　

　　丙肝感染可使用聚乙二醇化干扰素---、利巴韦林和直接作用抗病毒药物，如索福布韦、西美普韦、利迪帕韦、奥比塔韦、达萨伯韦治疗。单药或多药治疗的使用和治疗时间严重依赖于丙肝基因型。　

　　目前，用于检测血浆或血清中丙肝基因型的核酸检测方法有real-timePCR、限制性片段长度多态性、异双迁移率分析、线探针法等。然而，不同方法的结果一致性较低。因此，特异区域NS5、core、E1、5’utr的序列分析被认为是型丙肝基因分型的金标准。然而，较长的周转时间、成本以及对样品处理的高度训练的专业人员的要求限制了序列分析在发达国家的使用。因此，需要一种快速、简单、精确和廉价的基因分型试验来执行精确的治疗方案来管理丙型肝炎。　

　　最近，我们报道了6种丙肝基因分型9G试验，用于准确检测血浆样本中1a、1b、2、3、4、6种丙肝基因型。丙肝基因分型9G试验对含10份/试验样本的敏感性和特异性报道为100%。然而，在早期的研究中，只使用了63份丙肝样本来比较6种丙肝基因分型9G试验和VERSANT丙肝基因型2.0试验。小样本量的使用限制了试验的临床意义。值得注意的是，丙肝基因分型9G试验和LiPA2.0试验在盲样临床样本中没有比较丙肝基因分型。因此，本研究通过对280例疑似丙肝感染个体的血浆样本进行LiPA2.0法的丙肝基因分型对比，评估6丙肝9G试验的效果。对丙肝基因分型9G试验与LiPA2.0试验不一致的样本进行序列分析。　

　　丙肝基因分型9G检测的工作流程包括病毒RNA的分离、cDNA的合成、PCR的扩增，以及按照报道的9G技术在9G膜上检测氰基5.5(Cy5)标记的PCR扩增子。根据早期报道设计的丙肝基因型特异性ssDNA寡核苷酸探针被固定在9G膜的特定位置。将Cy5标记的PCR扩增子与固定化探针杂交，可以区分六种丙肝基因型。丙肝基因分型9G在PCR后30分钟内在25℃条件下检测丙肝1a、1b、2,3,4,6a或6f、6i或6n基因型。因此，丙肝基因分型9G测试可以使医生遵循EASL的建议，准确和高效的丙型肝炎管理。　

　　在全球范围内，丙肝1a和1b型约占46.2%的感染病例，其次是丙肝3(30.1%)、丙肝2301(9.1%)、丙肝4(8.3%)和丙肝(5.4%)。然而，丙肝在中国和东南亚几乎占了20%的感染。因此，正确鉴别这303个基因型至关重要。因此，本研究的目的是通过与LiPA2.0法和测序比较，评价丙肝基因分型9G试验的性能，以准确检测丙肝1a、1b、2、3、4、6个基因型。详情请扫码咨询：